Altbayern là một trong những vùng của Đức mà phần đông là theo đạo Công giáo Rôma. Vùng này thuộc tổng giáo phận München và Freising, giáo phận Passau và giáo phận Regensburg, và một phần cũng thuộc giáo phận Eichstätt và giáo phận Augsburg. Khác với vùng Franken, cho tới thế chiến thứ Hai, ở Altbayern ít có trộn lẫn các tôn giáo. Sau thế chiến thứ hai, nhiều người Đức có đạo Tin lành, đa số là những thành phần phải bỏ quê hương, cũng dọn vào những nơi mà trước đây chỉ toàn có người Công giáo cư trú.